控告法院的部门有以下几种选择：
法院纪检监察部门：
可以直接向法院的纪检监察部门提出投诉。
法院控告申诉部门：
可以向法院的控告申诉部门提出投诉。
上级法院控告申诉部门：
如果认为本院处理不当，可以向上级法院的控告申诉部门投诉。
纪委监察部门：
可以向当地的纪委或监察部门提出投诉，特别是如果认为法官存在违纪违法行为。
检察机关：
如果认为法官存在违法行为，可以向检察机关举报，检察机关有权对司法工作人员的违法行为进行侦查。
建议根据具体情况和投诉内容选择合适的部门进行投诉，以确保投诉得到及时有效的处理。
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