医保局通常归属于国家医疗保障局管理，或者隶属于当地人力资源和社会保障局。国家医疗保障局是国务院直属机构，负责全国范围内的医疗保险、生育保险、医疗救助等医疗保障制度的政策、规划、标准的制定与实施，并监督相关医疗保障基金的运行。
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