运输公司的做账方法包括以下几个方面：
收入确认
收到客户运输费用时：借：银行存款/现金 贷：主营业务收入-运输收入。
确认运输收入时：借：银行存款（或库存现金、应收账款等） 贷：主营业务收入-运输收入 贷：应交税费——应交增值税（销项税额）。
成本归集
发生运输成本时，如油费、路桥费等：借：主营业务成本-运输成本 贷：银行存款/现金。
购买运输工具或设备时：借：固定资产-运输设备 贷：银行存款/应付账款。
计提运输工具折旧时：借：主营业务成本-折旧费 贷：累计折旧。
支付员工工资时：借：主营业务成本-工资福利 贷：银行存款/现金。
支付货运车维修费：借：劳务成本-运输成本 贷：库存现金。
税费计算
缴纳各种税费时，如增值税、企业所得税等：借：应交税费-应交增值税/应交企业所得税 贷：银行存款。
其他费用
发生其他费用，如办公费、维修费等：借：管理费用-办公费/维修费 贷：银行存款/现金。
年末结转
年末结转收入和成本至本年利润时：借：主营业务收入 贷：本年利润；借：本年利润 贷：主营业务成本。
利润分配
分配利润时：借：本年利润 贷：利润分配-未分配利润。
实际分配利润给股东时：借：利润分配-未分配利润 贷：应付股利。
预收与结算
预收运费：借：银行存款 贷：预收账款。
完成运输任务，结算多退少补：借：预收账款 贷：主营业务收入-运输收入银行存款。
相关凭证与报表
根据原始凭证或原始凭证汇总表填制记账凭证。
根据收付记账凭证登记现金日记账和银行存款日记账。
根据记账凭证登记明细分类账。
根据记账凭证汇总、编制科目汇总表。
根据科目汇总表登记总账。
期末根据总账和明细分类账编制资产负债表和利润表。
以上是运输公司做账的基本方法和流程，具体操作时还需根据企业实际情况和当地税务部门的要求进行调整。
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